Ką kužda virusai?
Richard Neher dirbantis Bazelio universitete su savo komanda atlieka viešai prieinamų SARS-CoV-2 genomų filogenetines analizes ir jas pateikia platformoje nextstrain.org;
Jas galite pamatyti čia: https://nextstrain.org/groups/neherlab/ncov/lithuania?d=tree,frequencies&f_country=Lithuania&m=div&p=full
Svetainėje esančiame medyje paryškinti SARS-CoV-2 genomai iš Lietuvos, apačioje parodyti kiekvienos pažymėtinos atmainos dažnis. Kuri atmaina, tikėtina, Lietuvoje sukėlė mirtiniausią COVID-19 atvejų bangą 2020-2021 m. žiemą? Ar ji buvo ypatinga?
Richard Neher kolega Trevor Bedford panašiai yra paruošęs Vakarų Afrikos Ebolos viruso epidemijos 2013-2016 m. analizę čia: https://nextstrain.org/ebola?c=country
Kurioje šalyje pasak šios analizės prasidėjo epidemija? Ankstyvoje epidemijos stadijoje Ebolos virusas pateko į Siera Leonę – ar galite rasti šį šuolį medyje? Kiek Ebolos viruso genomų vėliau yra tiesiogiai kilę iš žmogaus keliavusio į Siera Leonę?